2型免疫反應是機體抵御寄生蟲感染的重要防御機制,但過度的2型免疫反應會引發(fā)一系列病理性變應性疾病,如哮喘、食物過敏和特應性皮炎。該反應起始于上皮細胞釋放的警報素(Alarmins),包括胸腺基質(zhì)淋巴細胞生成素(TSLP)、白細胞介素-25(IL-25)和IL-33。這些因子觸發(fā)級聯(lián)反應,最終釋放標志性的2型細胞因子IL-4、IL-5和IL-13(4)。這些細胞因子激活嗜酸性粒細胞、肥大細胞、第2組固有淋巴細胞(ILC2s)和輔助性T細胞2(TH2細胞),共同介導以粘液過度分泌、組織重塑和過敏性炎癥為特征的2型免疫應答(5-7)。靶向IL-4/IL-13和TSLP的生物制劑在多種2型過敏性疾病中的臨床應用及療效,進一步證實了這些細胞因子的過度產(chǎn)生與疾病發(fā)生的內(nèi)在關聯(lián)。然而,調(diào)控2型免疫反應失調(diào)的內(nèi)在細胞與分子機制,特別是其穩(wěn)態(tài)抑制機制,尚未完全闡明。在此,研究人員揭示了腸道絨毛細胞,一種以觸發(fā)2型免疫激活而聞名的特殊上皮細胞,還具有抑制2型反應的分子回路。在絨毛細胞中敲除轉(zhuǎn)錄因子Spi-B即足以引發(fā)自發(fā)性2型炎癥。絨毛細胞內(nèi)源性缺乏Spi-B使原本對食物過敏模型具有抵抗力的C57BL/6J小鼠變得易感。Spi-B抑制了由c-Kit信號驅(qū)動的絨毛細胞產(chǎn)生2型警報素TSLP。破壞這一負調(diào)控軸會導致絨毛細胞增生,并加劇2型炎癥,這可以通過酪氨酸激酶抑制劑進行藥物靶向治療。這些發(fā)現(xiàn)確定了2型免疫反應中以絨毛細胞為中心的關鍵檢查點,并突出了絨毛細胞在促進和抑制2型反應中的雙重作用。本文于2025年7月發(fā)表于《Signal Transduction and Targeted Therapy》,IF 52.7。
技術路線
主要實驗結(jié)果:
1. 轉(zhuǎn)錄因子Spi-B的缺失可誘發(fā)小腸簇細胞過度增生及自發(fā)性2型炎癥
為探究小腸簇細胞的內(nèi)在調(diào)控機制,我們對野生型(WT)小鼠經(jīng)流式分選獲得的上皮細胞黏附分子陽性(EpCAM+)SiglecF+簇細胞進行了RNA-seq分析。在簇細胞的轉(zhuǎn)錄因子編碼基因中,編碼Ets家族轉(zhuǎn)錄因子Spi-B的Spib基因呈現(xiàn)為簇細胞內(nèi)表達水平最高且最具特異性的轉(zhuǎn)錄本之一(圖1A)。對已發(fā)表的小腸上皮細胞(IECs)scRNA-seq數(shù)據(jù)的分析進一步證實:Spib在簇細胞群體中呈現(xiàn)優(yōu)勢性高表達,其表達水平甚至超過公認的簇細胞主調(diào)控因子基因Pou2f3(圖1B)。重新分析已公開的RNA-seq數(shù)據(jù)顯示,Spib在多種小鼠組織的簇細胞中均保持持續(xù)高表達。為驗證上述發(fā)現(xiàn),我們通過小鼠小腸組織的免疫熒光染色原位檢測Spi-B表達。共聚焦顯微鏡分析表明,無論是否感染蠕蟲Heligmosomoides polygyrus,Spi-B均與簇細胞標志物雙皮質(zhì)素樣激酶1(DCLK1)存在共定位(圖1C)。綜上,這些發(fā)現(xiàn)凸顯了Spi-B作為一種高度特異性于杯狀細胞的標志性轉(zhuǎn)錄因子的重要性。
圖1.上皮Spi-B缺失會導致腸道黏膜自發(fā)性出現(xiàn)2型炎癥
為闡明Spi-B在簇細胞中的作用,我們構建了Spibfl/flVillin-Cre小鼠(下文簡稱SpibΔIEC),實現(xiàn)腸道上皮細胞(IECs)特異性Spib基因缺失。Spi-B缺失導致簇細胞數(shù)量與比例顯著增加,穩(wěn)態(tài)條件下較同窩對照小鼠升高3-6倍(圖1D-E)。同時,Spib缺陷小鼠的杯狀細胞數(shù)量及黏液分泌同步增加,但腸道絨毛整體結(jié)構及其他上皮細胞亞群(如潘氏細胞、增殖細胞)基本無變化。5-溴-2′-脫氧尿苷(BrdU)示蹤實驗證實Spib缺失不影響IECs整體增殖。此外,掃描電鏡分析未檢測到三毛滴蟲定植跡象,表明表型與原生動物感染無關。
為了全面評估Spi-B缺失所導致的轉(zhuǎn)錄變化,我們對來自未感染的SpibΔIEC小鼠和對照小鼠的小腸組織進行大規(guī)模RNA-seq分析發(fā)現(xiàn):SpibΔIEC小鼠中簇細胞特異性基因(如Dclk1、Trpm5)及蠕蟲感染相關轉(zhuǎn)錄本顯著上調(diào)(圖1F)。抗蠕蟲基因(如Pla2g4c、Gsdmc2)的上調(diào)促使我們比較SpibΔIEC小鼠與感染Heligmosomoides polygyrus蠕蟲14天(dpi)的野生型(WT)小鼠表達譜。Spib缺陷小鼠中大多數(shù)上調(diào)基因呈現(xiàn)與蠕蟲感染誘導基因高度相似的表達模式(圖1G)。基因集富集分析(GSEA)進一步顯示,Spib缺陷小鼠中tuft-1與tuft-2細胞群均顯著富集,其中tuft-2細胞富集程度更高。以上表明:Spib缺失可誘導抗蠕蟲基因程序表達,形成“類蠕蟲感染”轉(zhuǎn)錄譜,即使在沒有蠕蟲的情況下也是如此。
為驗證Spi-B缺失是否導致功能表型模擬,我們檢測蠕蟲感染效應分子表達:Spib缺陷小鼠IECs中Sprr2a、Gsdmc2和Retnlb顯著上調(diào)(圖1H),這些基因在蠕蟲感染中強誘導。其中Gasdermin C(Gsdmc)與抵抗素樣分子β(RELMβ)在蠕蟲感染中高表達,分別介導IL-33釋放和蠕蟲排出。與轉(zhuǎn)錄水平一致,SpibΔIEC小鼠小腸Gsdmc與RELMβ蛋白表達同步升高(圖1I-J),提示出現(xiàn)了活躍的2型免疫應答。除簇細胞擴增和上皮重塑外,SpibΔIEC小鼠還表現(xiàn)出小腸長度增加與肌層增厚(圖1K-L),此表型與蠕蟲感染后簇細胞增生特征一致。綜上,Spi-B缺失可誘發(fā)自發(fā)性2型炎癥狀態(tài),其特征為簇細胞增生、抗蠕蟲效應分子上調(diào)和類蠕蟲感染的腸道重塑,證實Spi-B在抑制過度2型炎癥中的關鍵作用。
2. 簇細胞固有的Spi-B可抑制蠕蟲及食物過敏原誘導的2型應答
為明確Spi-B在簇細胞中的固有功能,我們構建并驗證了他莫昔芬誘導型Spibfl/flPou2f3-CreERT2小鼠(圖2A-B,下文簡稱SpibΔTuft)。盡管SpibΔIEC小鼠出現(xiàn)預期微皺褶細胞(M細胞)缺失,SpibΔTuft小鼠仍維持正常M細胞發(fā)育,證實簇細胞特異性Spib缺失。與SpibΔIEC表型一致,簇細胞特異性Spi-B缺失在穩(wěn)態(tài)下導致簇細胞增生(經(jīng)Dclk1與綠色熒光蛋白(GFP)標記Pou2f3共染色證實)(圖2C-D)。伴隨簇細胞數(shù)量/頻率增加,SpibΔTuft小鼠較同窩對照呈現(xiàn)小腸延長與肌層增厚(圖2E-G)。上述表型重現(xiàn)證實:Spi-B以簇細胞固有方式限制其過度擴增并維持組織穩(wěn)態(tài)。
圖2. 簇細胞固有Spi-B抑制簇細胞過度擴增并調(diào)控抗蠕蟲感染與食物過敏原的2型免疫應答
為驗證穩(wěn)態(tài)下觀察到的差異是否影響宿主對2型刺激的應答,我們對SpibΔTuft小鼠及對照進行Heligmosomoides polygyrus幼蟲感染(圖2H)。與Spi-B充足對照組相比,SpibΔTuft小鼠表現(xiàn)出蟲荷與蟲卵負荷同步下降,提示抗蠕蟲感染能力增強(圖2I)。一致地,SpibΔIEC小鼠也顯示更強的蠕蟲防御能力,具體表現(xiàn)為蟲荷減少、產(chǎn)卵量下降、杯狀細胞數(shù)量增加及黏液分泌增多(圖2J)。
除抗蠕蟲免疫外,2型免疫應答在影響全球10%人群的食物過敏發(fā)病機制中起核心作用。為評估Spi-B缺失對食物過敏原易感性的影響,我們采用花生提取物(PE)建立食物過敏模型(圖2K)。在通常具有抵抗力的C57BL/6J背景下,SpibΔTuft小鼠表現(xiàn)出核心體溫下降及低體溫發(fā)生率上升,表明對食物過敏原致敏的敏感性增強(圖2L)。膳食抗原引發(fā)的過敏反應源于肥大細胞擴增與活化,其標志是肥大細胞蛋白酶-1(Mcpt1)水平升高。經(jīng)PE再次激發(fā)后,SpibΔTuft小鼠較對照組呈現(xiàn):上皮內(nèi)Mcpt1+肥大細胞數(shù)量增加、血清Mcpt1濃度升高以及花生特異性免疫球蛋白E(IgE)水平上升(圖2M-O)。過敏原激發(fā)后還觀察到肥大細胞與嗜酸性粒細胞比例增加。綜上表明:簇細胞固有Spi-B通過抑制蠕蟲感染與食物過敏原引發(fā)的過度2型免疫應答,維持免疫穩(wěn)態(tài)。
3. 簇細胞固有Spi-B通過調(diào)控TH2細胞應答抑制2型免疫
為闡明Spi-B缺失驅(qū)動自發(fā)性2型免疫的機制,我們在小腸類器官中發(fā)現(xiàn):無論是否存在IL-4,Spi-B缺失均不影響簇細胞分化,表明Spi-B不直接調(diào)控腸干細胞向簇細胞的譜系定向。隨后通過固有層(LP)免疫細胞區(qū)室免疫表型分析探究簇-免疫細胞互作。結(jié)果顯示:嗜酸性粒細胞、巨噬細胞及樹突細胞等先天免疫細胞群比例無顯著變化;SpibΔIEC小鼠與對照組的ILC2s比例及其IL-13分泌水平亦相當,提示ILC2s在Spib缺失背景下貢獻有限。
在小腸固有層CD4+ T輔助細胞亞群中,SpibΔIEC小鼠呈現(xiàn)明顯的TH2表型極化(圖3A-B)。與對照相比,其GATA3+ TH2細胞比例與數(shù)量增加,而RORγt+ TH17細胞頻率降低(圖3B-C)。細胞因子檢測進一步顯示:Spib缺陷小鼠TH2細胞的IL-13分泌增加,但IL-4分泌未變(圖3D)。在SpibΔTuft小鼠中也觀察到TH2細胞豐度與IL-13分泌增強(圖3E-F),證實Spi-B以簇細胞固有方式調(diào)控TH2應答。信號轉(zhuǎn)導與轉(zhuǎn)錄激活因子6(STAT6)作為IL-13信號激活的關鍵轉(zhuǎn)錄因子,可驅(qū)動腸上皮簇細胞增生。與TH2細胞IL-13分泌增加一致,免疫染色顯示SpibΔIEC小鼠上皮細胞內(nèi)STAT6酪氨酸磷酸化水平升高(圖3G-H)。
圖3. Spi-B通過調(diào)控TH2細胞應答抑制腸道簇細胞擴增
為闡明適應性免疫細胞的作用,我們構建了Rag1?/? SpibΔIEC小鼠。Rag1缺失可消除SpibΔIEC小鼠的自發(fā)性2型炎癥表型,包括簇細胞增生、上皮重塑及平滑肌增厚(圖3I-J)。此外,IL-13中和抗體處理能消除SpibΔIEC小鼠的簇細胞增生(圖3K-L),表明過量IL-13是Spi-B缺失誘導簇細胞增生的關鍵驅(qū)動因子。綜上證明:Spi-B通過限制TH2細胞豐度及反應性,內(nèi)在調(diào)控簇細胞擴增。
4. 簇細胞源性TSLP驅(qū)動Spi-B缺失誘導的簇細胞增生
為探究Spi-B調(diào)控TH2活性及簇細胞增生的內(nèi)在機制,我們對分選的野生型(SpibWT)與SpibΔIEC小鼠簇細胞進行批量RNA測序(圖4A)。警報素細胞因子基因Tslp在Spib缺陷簇細胞中上調(diào)最顯著(圖4A)。多組獨立實驗證實:SpibΔIEC與SpibΔTuft小鼠簇細胞的Tslp mRNA表達量較對照組升高6-8倍,而另一警報素Il25表達不變(圖4B-C)。小腸分泌性TSLP蛋白水平在Spib缺陷小鼠中同步升高(圖4D-E)。單分子熒光原位雜交(smFISH)顯示Tslp轉(zhuǎn)錄本特異性富集于Spib缺陷簇細胞,證實其為TSLP升高的主要來源(圖4F-G)。
圖4. 簇細胞源性TSLP參與Spi-B缺失觸發(fā)的簇細胞擴增
鑒于TSLP的強效2型免疫誘導能力,我們進一步驗證其功能貢獻:給予TSLP中和抗體可消除Spib缺陷小鼠的簇細胞數(shù)量增加、TH2細胞比例升高、STAT6活化及RELMβ產(chǎn)生(圖4H-L),證實TSLP在該自發(fā)性2型應答中不可或缺。雖然ILC2s高表達Il17rb,但TH2細胞呈現(xiàn)更高TSLP受體(TSLPR,由Crlf2編碼)水平。為探究CD4+ T細胞TSLPR在簇細胞增生中的作用,我們將CRISPR-Cas9體外編輯的Crlf2缺陷型或?qū)φ誄D4+ T細胞過繼移植至Rag1?/?SpibΔIEC小鼠(圖5A)。盡管固有層CD4+ T細胞比例相似,但接受sgCrlf2 CD4+ T細胞的小鼠表現(xiàn)出簇細胞數(shù)量減少、TH2細胞頻率降低及Retnlb表達下降(圖5B-C),證明CD4+ T細胞的TSLPR促進Spi-B缺失誘導的2型炎癥。此外,廣譜抗生素處理可消除Spib缺陷小鼠的簇細胞增生,提示微生物群在此條件下參與簇細胞擴增。
圖5. 簇細胞源性TSLP促進Spi-B缺陷小鼠的CD4+ T細胞依賴性簇細胞增生及過敏應答
為驗證TSLP升高是否介導SpibΔTuft小鼠的食物過敏癥狀,TSLP阻斷處理有效阻止了特征性體溫下降并降低血清Mcpt1與IgE水平(圖5D-G)。綜上表明:Spi-B在穩(wěn)態(tài)下抑制簇細胞TSLP產(chǎn)生,其缺失導致的簇細胞源性TSLP升高驅(qū)動簇細胞增生。
5. 簇細胞Spi-B對Kit的轉(zhuǎn)錄抑制
為解析TSLP抑制機制,我們采用靶向切割與轉(zhuǎn)座酶技術(CUT&Tag)分析簇細胞Spi-B-DNA互作(圖6A)。Spi-B結(jié)合峰廣泛分布于基因組各區(qū)域(圖6B)。整合Spi-B CUT&Tag啟動子結(jié)合位點與RNA-seq上調(diào)基因(圖4A),鑒定出22個重疊基因(圖6C)。其中Kit在Spib缺陷簇細胞中上調(diào)最顯著。CUT&Tag顯示:Spi-B在野生型簇細胞中直接結(jié)合Kit啟動子,該結(jié)合在缺陷細胞中消失(圖6D);而Tslp、Il25等基因調(diào)控區(qū)無特異性結(jié)合。SpibΔIEC與SpibΔTuft小鼠中均證實Kit/c-Kit在mRNA與蛋白水平表達升高,且c-Kit高表達簇細胞比例增加(圖6E-H)。為明確c-Kit升高是否為上皮細胞自主現(xiàn)象,小腸類器官實驗顯示:無免疫細胞存在時,Spib缺陷簇細胞仍呈現(xiàn)c-Kit上調(diào)(圖6I)。熒光素酶報告基因?qū)嶒炞C實Spi-B以劑量依賴方式轉(zhuǎn)錄抑制Kit啟動子,且該抑制依賴其完整的反式激活與DNA結(jié)合域(圖6J)。
圖6. Spi-B在簇細胞內(nèi)源性抑制Kit表達
伴隨c-Kit表達增強,Spib缺陷簇細胞中STAT5磷酸化水平(c-Kit信號標志)升高(圖6K)。STAT5在小腸上皮細胞中結(jié)合內(nèi)源性Tslp基因座的預測增強子與啟動子區(qū)(非基因體區(qū))(圖6L)。在CMT-93上皮細胞中表達組成型活化STAT5(CA-STAT5)可增加Tslp轉(zhuǎn)錄(圖6M),提示c-Kit-STAT5信號轉(zhuǎn)錄驅(qū)動TSLP表達。為驗證c-Kit信號對TSLP誘導及簇細胞增生的必要性,采用c-Kit抑制劑ISCK03(強效選擇性抑制劑)進行藥理學干預,可有效緩解Spib缺陷小鼠的簇細胞增生、Tslp表達、TH2細胞比例及IL-13分泌(圖6N-P)。蠕蟲感染與食物過敏模型中,簇細胞呈現(xiàn)Spib下調(diào)伴隨c-Kit與Tslp升高,表明該通路在此類條件下被激活。綜上揭示:Spi-B作為Kit轉(zhuǎn)錄抑制因子,通過限制c-Kit表達抑制TSLP產(chǎn)生。
6. 簇細胞固有Spi-B-Kit-TSLP回路調(diào)控腸道2型免疫
為明確c-Kit在簇細胞中的功能,我們構建并驗證Kitfl/flPou2f3-CreERT2(KitΔTuft)小鼠,進一步與Spibfl/fl雜交獲得簇細胞特異性雙敲除(SpibΔTuftKitΔTuft)小鼠。他莫昔芬誘導基因缺失后,雙敲除小鼠較SpibΔTuft小鼠表現(xiàn)出絨毛內(nèi)簇細胞數(shù)量與頻率降低(圖7A-C)。Kit缺失導致類器官簇細胞STAT5磷酸化減弱,體內(nèi)外Tslp表達下降及TH2細胞比例減少(圖7D-E),證實c-Kit是Tslp表達與TH2介導2型免疫病理的上游調(diào)控因子。表型上,簇細胞c-Kit缺失削弱SpibΔTuft小鼠的抗蠕蟲防御增強效應,表現(xiàn)為蟲卵負荷增加與上皮Retnlb表達降低(圖7F)。同時c-Kit缺失改善食物過敏表型:核心體溫回升、血清Mcpt1下降及肥大細胞擴增減弱(圖7G-H)。上述發(fā)現(xiàn)共同證明:簇細胞固有Spi-B-Kit-TSLP軸對維持簇細胞穩(wěn)態(tài)及應答激活刺激后的2型免疫至關重要。
圖7. 簇細胞固有Spi-B通過限制c-Kit-TSLP軸抑制2型免疫
為探索靶向c-Kit過度活化在食物過敏中的治療潛力,我們使用FDA批準酪氨酸激酶抑制劑伊馬替尼(Gleevec)(圖7I)。與機制研究選用ISCK03不同(圖6N),伊馬替尼因其成熟的臨床應用及治療c-Kit依賴性疾?。ㄈ缏运柘蛋籽。┑陌踩员贿x為治療模型。伊馬替尼處理顯著減輕SpibΔTuft與野生型小鼠的食物過敏反應發(fā)展與嚴重程度,表現(xiàn)為體溫恢復及血清Mcpt1降低(圖7J-K)。靶向c-Kit通路是潛在的過敏治療策略。
Spi-B缺失背景下,TSLP上調(diào)與2型應答過度活化至少部分由c-Kit信號介導。c-Kit作為受體酪氨酸激酶,在造血干細胞與肥大細胞等增殖分化中起關鍵作用。腸道中c-Kit功能見于腸干細胞、潘氏細胞與杯狀細胞,但其在簇細胞中的作用未知??赡芤蛞吧痛丶毎鹀-Kit基礎表達極低導致研究缺失。進一步遺傳學剔除該低水平c-Kit未引起簇細胞豐度與功能的顯著改變(圖7C-D)。簇細胞低c-Kit表達非被動事件,而是Spi-B主動轉(zhuǎn)錄抑制的結(jié)果。該抑制解除后,c-Kit高表達驅(qū)動TSLP介導的簇細胞增生,甚至使C57BL/6J小鼠對食入性過敏原易感。食物過敏中簇細胞Spib下調(diào)伴隨c-Kit與Tslp升高支持該通路的臨床相關性。使用臨床藥物伊馬替尼抑制c-Kit過度活化可緩解過敏病理發(fā)展。但鑒于c-Kit在肥大細胞等廣泛表達,且伊馬替尼對其他酪氨酸激酶有抑制效應,c-Kit在簇細胞中的精確作用及治療潛力需進一步研究。本研究為靶向簇細胞區(qū)室、調(diào)控Spi-B-Kit-TSLP軸以恢復免疫穩(wěn)態(tài)和改善2型病理提供了機制框架。
參考文獻:
Wang J, Shen R, Yang K, Guo X, Yu J, Wu C, Guo XK, Hu X. Tuft cells restrain intestinal type 2 immunity through the transcription factor Spi-B. Sci Immunol. 2025 Jul 4;10(109):eads5818. doi: 10.1126/sciimmunol.ads5818. Epub 2025 Jul 4. PMID: 40614214.